姓名: 职晓阳

职称: 副研究员

电子邮件: xyzhi@ynu.edu.cn

实验室网站: www.mselab.cn

简历：

1. 1999.09-2003.07，河南师范大学，菠菜网最稳定正规平台，获学士学位；

2. 2004.09-2007.07，全球最大的菠菜网，菠菜网最稳定正规平台，微生物学，获硕士学位；

3. 2008.11-2010.05，美国俄克拉荷马大学，环境基因组研究中心，公派联合培养博士生；

4. 2007.09-2010.07，全球最大的菠菜网，菠菜网最稳定正规平台，微生物学专业，获博士学位；

5. 2010.08-2016.11，全球最大的菠菜网，菠菜网最稳定正规平台云南省微生物研究所，助理研究员；

6. 2014.02-2015.02，复旦大学，物理系理论生命研究中心，访问学者。

7. 2016.12至今，全球最大的菠菜网，菠菜网最稳定正规平台云南省微生物研究所，副研究员。

研究方向：

原核微生物系统学与进化生物学。借助生物信息学技术，开展涉及微生物代谢通路的分子进化、原核微生物特定类群的系统发育基因组学、以及特殊生境微生物生态适应的组学机制等方向的研究工作。

代表论文 (*:通讯作者；†:共同第一作者)：

1. Tang SK†, Zhi XY†, Zhang Y†, Makarova K-S†, Liu BB†, Zheng GS, ..., Yang LL, ..., Koonin EV*, Zhao GP*, Xu P*. Cellular differentiation into hyphae and spores in halophilic archaea. Nat Commun. 2023 14:1827.

2. Wang M†, Li CJ†, Zhang Z, Li PP, Yang LL, Zhi XY*. The evolution of morphological development is congruent with the species phylogeny in the genus Streptomyces. Front Microbiol. 2023 14:1102250.

3. Tan W†, Liao TH†, Wang J, Ye Y, Wei YC, Zhou HK, Xiao Y, Zhi XY*, Zhao ZH*, Lyu LD*, Zhao GP*. A recently evolved diflavin-containing monomeric nitrate reductase is responsible for highly efficient bacterial nitrate assimilation. J Biol Chem. 2020 295(15):5051-5066.

4. Yang LL, Jiang Z, Li Y, Wang ET, Zhi XY*. Plasmids related to the symbiotic nitrogen fixation are not only cooperated functionally, but also may have evolved over a time span in family Rhizobiaceae. Genome Biol Evol. 2020 12(11):2002-2014.

5. Zhi XY*, Zhao J, Yang LL, Huang Y. The underlying mechanisms of genetic innovation and speciation in the family Corynebacteriaceae: a phylogenomics approach. Mol Phylogenet Evol. 2017, 107: 246-255.

6. Yin YR†, Meng ZH†, Hu QW, Jiang Z, Xian WD, Li LH, Hu W, Zhang F, Zhou EM, Zhi XY*, Li WJ*. The Hybrid Strategy of Thermoactinospora rubra YIM 77501T for Utilizing Cellulose as a Carbon Source at Different Temperatures. Front Microbiol. 2017 8:942.

7. Yang LL, Tang SK, Huang Y, Zhi XY*. Low Temperature Adaptation Is Not the Opposite Process of High Temperature Adaptation in Terms of Changes in Amino Acid Composition. Genome Biol Evol. 2015, 7(12): 3426-3433.

8. Zhi XY*, Yao JC, Li HW, Huang Y, Li WJ. Genome-wide identification, domain architectures and phylogenetic analysis provide new insights into the early evolution of shikimate pathway in prokaryotes. Mol Phylogenet Evol. 2014, 75:154-164.

9. Zhi XY*, Yao JC, Tang SK, Huang Y, Li HW, Li WJ. The futalosine pathway played an important role in menaquinone biosynthesis during early prokaryote evolution. Genome Biol Evol. 2014, 6: 149-160.

10. Zhi XY, Tang SK, Li WJ. Genus I. Jiangella Song, Li, Wang, Chen, Zhang and Xu 2005. In Bergey's Manual of Determinative Bacteriology Volume 5, The Actinobacteria, Whitman W.B., Goodfellow M., Kämpfer P., et al., Eds. 2012 Springer Press.

论文清单: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Xiao-Yang+Zhi。

承担科研项目情况：

1. 高温放线菌基因组系统发育与温度适应性进化机制研究，国家自然科学基金地区项目，编号32060003. 2021.01-2024.12

2. 全球最大的菠菜网第六批“青年英才培育计划”，全球最大的菠菜网，2020.1-2023.12

3. 云南省“万人计划”青年拔尖人才项目，云南省人社厅，2019.01-2023.12

4. 原核生物细胞质膜组分合成酶及其基因的分子进化研究，国家自然科学基金地区项目，编号31560309. 2016.1-2019.12

5. 放线菌门核糖体进化与系统分类学研究，国家自然科学基金青年项目，编号31100008. 2012.1-2014.12

获奖及荣誉：

1. 2017年因“中国西部高温、高盐极端微生物系统学及生态学研究”项目获云南省科学技术奖（自然科学类）二等奖（排名第三）；

2. 2010年教育部自然科学二等奖（排名第四），项目名称：“新疆青海高盐环境可培养嗜盐放线菌多样性研究”；

3. 2009年云南省自然科学奖一等奖（排名第四），项目名称：“放线菌系统学研究”；